序自序续序凡例卷之上痧症发蒙论玉衡要语痧分表里辨治痧宜看凉热唇舌辨大小便宜通咽喉治法治痧当绝其根痧原论治痧当分经络痧与杂症轻重不同治痧三法痧前禁忌痧后禁忌痧胀凶症痧为百病变症医家当识痧筋放痧有十放痧须
伤寒心境别集
序张序卷上卷上后藤艮山北山友松和田东郭荻野台洲华冈青洲卷下永富独啸庵惠美宁固福岛慎独轩田中适所福井枫亭高端枳园多纪桂山多纪庭黄跋书《先哲医话》后
序卷上流注指微针赋流注经络井荥说平人气象论经隧周环图手太阴肺经手阳明大肠经足阳明胃经足太阴脾经手少阴心经手太阳小肠经足太阳膀胱经足少阴肾经手厥阴心包经手少阳三焦经足少阳胆经足厥阴肝经卷中井荥俞经合部分
叙言卷一调经古今方十九首种子时方三首外备方三首卷二胎前金匮方八首时方九首卷三产后金匮方论一十一首卷四杂病金匮方一十九首外科眼目瘰乳痈乳岩（附）乳缩乳卸附∶妇人阴挺论续记
治愈半身不遂一例治愈智迟一例治愈胆虚一例治愈呆病一例治愈高热一例治愈胃脘痛一例治愈梅核气一例治愈脏躁一例治愈偏枯一例治头风一例
秘藏膏丹丸散方剂
洄溪医案
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄
初生沐浴噤风撮口脐风气闭啼伤风咳嗽疟吐吐泻霍乱积痢疳肿胀惊风惊风死症歌脉法慢惊慢脾风毒惊瘫鹤膝候痫腹痛虫心痛咽喉暑脱肛热黄胆淋症（附白尿）眼目赤肿痧疹