正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
简介序卷之一卷之二卷之三卷之四卷之五卷之六卷之七卷之八卷之九卷之十卷之十一卷之十二卷之十三卷之十四卷之十五卷之十六卷之十七卷之十八卷之十九卷之二十丹波元胤跋
序针经标幽赋流注通玄指要赋针经直说络说交经辨气血问答手足三阴三阳表里支干配合流注八穴序定八穴所在真言补泻手法夫妇配合古法流注杂忌法针灸避忌太一之图序冬至叶蛰宫说附∶针灸杂说窦汉卿流注指要后序
序一序二备急灸法屈指量法例诸发等证肠痈疔疮附骨疽皮肤中毒风卒暴心痛转胞小便不通霍乱霍乱转筋风牙疼精魅鬼神所淫夜魇不寤卒忤死法溺水自缢急喉痹鼻衄妇人难生小肠气一切蛇伤治犬咬治狂犬所咬点灸法下火法用火法候
周序原序卷首女科总论胎产脉候调经章不及期而经先行经过期而后行一月而经再行经行或先或后经将行腹痛经水多少经水紫淡色经闭不行石瘕肠覃崩漏章崩漏经血妄行赤白带下白浊白淫白带辨症种子章保胎辑要总论受胎保护难产
贾序范序查序鲁序全书纪略卷之一入集 传忠录（上）明理（一）阴阳篇（二）六变辩（三）表证篇（四）里证篇（五）虚实篇（六）寒热篇（七）寒热真假篇（八）十问篇（九）论治篇（十）气味篇（十一）卷之二入集 传忠
序卷上疮科总论五发痈疽论五发痈疽通治方疔疮论瘰论卷下肠痈痔论乳痈论肺痈论诸疳疮论附骨疽论诸疮论疥癣论瘿瘤论疮论便毒论
自序原病篇卷一·上焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温伏暑湿温、寒湿温疟秋燥补秋燥胜气论卷二·中焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温、伏暑寒湿湿温秋燥卷三·下焦篇风温、温热、温疫、温毒、冬温暑温、伏暑
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