赵序吴序卷一阴阳脏腑亢害承制卷二望色切脉辨证施治卷三二十六字符机理固润涩通塞清扬逆从求责缓峻探兼候夺寒热补泻提越应验卷四用药权衡炮制心法卷五古经解卷五古方解十全大补汤·八珍汤归脾汤补中益气汤四君子汤四
长沙方歌括
诸病主病诗
叙卷一·琼瑶神书天部宋徽宗皇帝崇宁五年琼瑶真人一书手法序一琼瑶真人用升阳升阴气上气下之手法讲论歌二琼瑶标本运气歌三琼瑶辨十二经水火分治法四宋徽宗崇宁皇帝论五论手足阴阳流注篇六络脉传注周流不息七琼瑶真人
孙序徐序沈序卷一华佗论病理神方一○○一·论人法与天地一○○二·论阴阳大要一○○三·论生成一○○四·论阳厥一○○五·论阴厥一○○六·论阴阳痞格一○○七·论寒热一○○八·论虚实大要一○○九·论上下不宁一○
叙例言上卷人身阴阳五脏所生五脏所属五脏所藏五脏所主脏腑所合脏腑之官五藏九窍男女天癸血气所生营卫生会六经六气经气主治十二经脉冲任督带下卷全体总论五脏所伤五脏所恶脏腑为病诸病所属四时所病脏腑通治望形察色闻
第1部分第2部分第3部分第4部分
序原叙原例（次序略经更定）通行经络（补）人参高丽参黄精大枣面鹿肉羊肉鳝鱼淡菜人乳人气紫河车（和）甘草香附连翘合欢皮芜荑海桐皮乳香没药竹沥荆沥广皮枳子菠菜荠菜白豆酒灵砂百沸汤鹈鹕油蜂蜜（攻）大戟甘遂商陆
自序凡例卷一月经治月经病方卷二胎前治胎前病方秦氏世传逐月养胎方卷三小产治小产病方临产治临产病方附前人治临产效方卷四产后治产后病方卷五带下治滞下病方崩漏治崩漏病方附录前人治临产效方卷六妇女杂病治妇女杂病
原序附刊丹方补遗序自序凡例贸药辨真假诸症歌诀单方经验丹方汇编中风预防中风风气痛（附痿症、脱颏）虚劳血证肿胀反胃噎膈痰饮咳嗽梦遗白浊伤寒瘟疫（附冒风寒方）疟疾痢疾肠风下血便血淋漓并小便闭塞霍乱吐泻（附痧