绪言第一卷温热总论论温热四时皆有（添加）论温热五种辨法论温热与风寒各异论温热伏气与新感不同（添加）论温热即是伏火（添加）论湿火之症治论燥火之症治论温热本症疗法（添加）论温热兼症疗法其一兼风其二兼寒其三
黄庭内景五藏六府图
序一序二凡例卷之一伤寒伤寒论两感论附：嗣真少阴症似太阳太阳脉似少阴不同论太阳论阳明少阳论三阴论三焦论阴证论阴虚论内伤论表症论里症论热症论舌论附金镜录辨舌黑治法结胸论发狂谵语蓄血发发疹（附）发黄吐蛔厥症
编写说明导言一、干支配属（一）天干的阴阳五行属性与方位（二）天干配属脏腑经络与五季（三）天干配属五运（四）地支纪月与所属四季（五）地支所属阴阳五行（六）地支配合时间与脏腑经络二、年、月、日、时干支掌上
序一序二备急灸法屈指量法例诸发等证肠痈疔疮附骨疽皮肤中毒风卒暴心痛转胞小便不通霍乱霍乱转筋风牙疼精魅鬼神所淫夜魇不寤卒忤死法溺水自缢急喉痹鼻衄妇人难生小肠气一切蛇伤治犬咬治狂犬所咬点灸法下火法用火法候
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
《旧德堂医案》提要《旧德堂医案》序自叙小叙《旧德堂医案》正文
序原叙原例（次序略经更定）通行经络（补）人参高丽参黄精大枣面鹿肉羊肉鳝鱼淡菜人乳人气紫河车（和）甘草香附连翘合欢皮芜荑海桐皮乳香没药竹沥荆沥广皮枳子菠菜荠菜白豆酒灵砂百沸汤鹈鹕油蜂蜜（攻）大戟甘遂商陆
序录上序录下解毒服药忌食药不宜入汤酒者上石类上草木类上虫兽类玉石上品玉石中品玉石下品草木上品草木中品草木下品虫兽上品虫兽中品虫兽下品玉石三品玉石上品玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石
本事方续集